服务项目

探针设计合成

服务概述

根据提供的基因序列,采用寡核苷酸设计软件,设计出候补探针序列,经数据库比对后,判断特异性合格后,按序列合成出对应的核酸序列并标记特定的标记物。

服务周期:

技术介绍

基于目标基因序列,通过寡核苷酸设计软件筛选候选探针,经NCBI等数据库进行同源性比对验证特异性。合格序列通过化学合成法生成带标记物(如地高辛、荧光素)的核酸探针,确保探针与靶序列的特异性结合能力。

实验流程

  1. 1.1 设计
    使用Oligo7、Primer Premier等软件设计50-80bp探针序列,Tm值控制在60-80℃,GC含量40-60%,避免发夹结构及二聚体形成。
  2. 1.2 合成
    采用固相亚磷酰胺三酯法,依次进行:
    ① 脱保护(三氯乙酸去除DMT基团)
    ② 耦连(活化核苷酸与载体连接)
    ③ 加帽(乙酸酐封闭未反应位点)
    ④ 氧化(碘溶液稳定磷酸三酯键)
  3. 1.3 氨解
    浓氨水55℃反应16小时,裂解CPG载体并去除碱基保护基团(苯甲酰基/异丁酰基)。
  4. 1.4 纯化
    HPLC纯化系统(C18反相柱),流动相为0.1M TEAA/乙腈梯度,收集260nm主峰。
  5. 1.5 质检
    质谱检测分子量误差≤0.1%,纯度>90%(A260/A280比1.8-2.0)。
  6. 1.6 定量分装
    NanoDrop测定浓度(OD值=1对应33μg/ml),冻干后-20℃避光保存。

案例展示

结果判读

合格探针需满足:质谱主峰分子量与理论值误差≤0.1%,HPLC纯度≥90%,终浓度标注误差±10%。不合格探针需重新合成纯化。

送样运输要求

  • 冻干粉态:4℃冰袋运输(有效期12个月)
  • 溶液状态:-20℃干冰运输(有效期3个月)

注意事项

  • 探针设计需避开SNP位点及重复序列区域
  • 修饰标记需在合成前确定连接位置(5'/3'/内部)
  • 冻干粉复溶需使用无核酸酶的超纯水
  • 避免反复冻融,建议分装为单次使用量