服务项目
探针设计合成
服务概述
根据提供的基因序列,采用寡核苷酸设计软件,设计出候补探针序列,经数据库比对后,判断特异性合格后,按序列合成出对应的核酸序列并标记特定的标记物。
服务周期:
技术介绍
基于目标基因序列,通过寡核苷酸设计软件筛选候选探针,经NCBI等数据库进行同源性比对验证特异性。合格序列通过化学合成法生成带标记物(如地高辛、荧光素)的核酸探针,确保探针与靶序列的特异性结合能力。
实验流程
- 1.1 设计
使用Oligo7、Primer Premier等软件设计50-80bp探针序列,Tm值控制在60-80℃,GC含量40-60%,避免发夹结构及二聚体形成。 - 1.2 合成
采用固相亚磷酰胺三酯法,依次进行:
① 脱保护(三氯乙酸去除DMT基团)
② 耦连(活化核苷酸与载体连接)
③ 加帽(乙酸酐封闭未反应位点)
④ 氧化(碘溶液稳定磷酸三酯键) - 1.3 氨解
浓氨水55℃反应16小时,裂解CPG载体并去除碱基保护基团(苯甲酰基/异丁酰基)。 - 1.4 纯化
HPLC纯化系统(C18反相柱),流动相为0.1M TEAA/乙腈梯度,收集260nm主峰。 - 1.5 质检
质谱检测分子量误差≤0.1%,纯度>90%(A260/A280比1.8-2.0)。 - 1.6 定量分装
NanoDrop测定浓度(OD值=1对应33μg/ml),冻干后-20℃避光保存。
案例展示
结果判读
合格探针需满足:质谱主峰分子量与理论值误差≤0.1%,HPLC纯度≥90%,终浓度标注误差±10%。不合格探针需重新合成纯化。
送样运输要求
- 冻干粉态:4℃冰袋运输(有效期12个月)
- 溶液状态:-20℃干冰运输(有效期3个月)
注意事项
- 探针设计需避开SNP位点及重复序列区域
- 修饰标记需在合成前确定连接位置(5'/3'/内部)
- 冻干粉复溶需使用无核酸酶的超纯水
- 避免反复冻融,建议分装为单次使用量